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扬子晚报网11月18日讯(记者 梅建明)近日,由南京农业大学国度大豆创新中心的邢光南副西宾主导并初度收效拼装和驻防了我国裂缝经济虫豸豆天蛾基因组。这一服从,不仅让东谈主们对豆天蛾的相识达到了一个全新高度,也为后续了解豆天蛾发育历程中复杂的调控机制、优化豆天蛾的东谈主工衍生期间提供了持重的数据资源。

图为本年暑假时分,邢光南副西宾与学生在田间交流商榷豆天蛾衍生专用品种筛选要害
据先容,豆天蛾,其幼虫笔名豆丹,原是农民口中所称的危害大豆的大青虫、大害虫。但是,因豆天蛾养分价值高,含有多种东谈主体必需氨基酸,可行动优质卵白着手。跟着经济发展以及东谈主们对健康饮食的关爱,豆天蛾需求越发焕发,其东谈主工衍生也快速兴起,并已成为江苏连云港等地区的裂缝好意思食。

图为豆天蛾基因组特点
邢光南副西宾告诉扬子晚报紫牛新闻记者,在洽商中,他萌生了探索豆天蛾基因组的方针。2023年10月,他携带颜宇璐等洽商生团队开动了豆天蛾基因组拼装、驻防的责任。团队汇集了五龄豆天蛾幼虫,用作基因组测序拼装的践诺对象。通过联接PacBio HiFi、Hi-C期间,初度拼装了豆天蛾高质地染色体水平基因组。拼装的基因组大小为477.45百万碱基对(Mb),contig N50为17.43 Mb。经过Hi-C搭建后,contigs被拼装到29条染色体上,挂载率为99.61%。该基因组通用单拷贝同源基因基准齐备性为99.49%,意味着险些通盘的裂缝基因齐如故被正确识别。基因组包含252.16 Mb的调换元件和14,214个卵白质编码基因。这些信息关于相识豆天蛾的生物学特点至关裂缝。通过比拟豆天蛾与香烟天蛾的基因组发现两者具有很强的共线性,香烟天蛾28号染色体与豆天蛾15号和29号染色体之间发生过染色体间分别或会通。而比拟豆天蛾与家蚕的基因组,发现豆天蛾染色体与家蚕染色体共线性进度较低,即染色体间会通和断裂的时局更经常。
此外,该洽商团队还驻防了一条环化且齐备的线粒体基因组序列,长度为15,417 bp。线粒体是细胞的能量工场,这条齐备的线粒体基因组为洽商豆天蛾的能量代谢提供了裂缝陈迹。该文发表于Scientific Data. 2024, 11: 1062。本次拼装的豆天蛾基因组,将为豆天蛾的潜入洽商,以及豆天蛾衍生期间的优化提供新想路、新决策。该课题组前期洽商鸿沟 清楚春播高感大豆品种南农89-29,栽培密度1万株/亩,在大豆V6期挂卵,挂卵密度1.7万粒/亩,可得到豆天蛾幼虫产量174斤/亩。

图为从外环到内环瓜代清楚的是染色体长度散播、GC含量、基因密度以及转座元件(DNA转座子、SINE、LINE和LTR)的散播
不久前,在邢西宾等巨匠的指引下,南京农业大学农学院学生石一涵等组建了豆天蛾暑期社会抓行团,赴淮安、连云港等地围绕豆天蛾衍生情况张开抓行调研,为处置豆天蛾东谈主工衍生中的难养、低产问题提议处置要害,积极促进当地相关产业的健康发展。
校对 陶善工欧洲杯体育
